Galvenie pētījumi saistās ar RSU AAI, kurā tiek plaši izmantotas histoķīmiskās un imūnhistoķīmiskās metodes: fluorescences, biotīna avidīna, biotīna streptavidīna; in situ hibridizācija; TUNEL tehnika; veikti arī šūnu kultūras pētījumi.
Galvenie pētījumu virzieni ir dažādu audu faktoru, ieskaitot gēnus, kompleksi pētījumi embrioloģijas jomā. Pētīti dažādi audu molekulārie notikumi, kā deģenerācija, reģenerācija, remodelācija, programmētā šūnu nāve, proliferācija, dabīgo antimikrobo faktoru aizsardzības sistēma, gēnu un to proteīnu/transkripcijas faktoru sadalījums audos. Doktora grādu medicīnā par pētījumiem anomāliju jomā, proti, šķeltnēm, ieguvusi Benita Krivicka-Užkurele (2010) un Liene Smane (2016), par I trimestra cilvēka dažādas implantācijas gadījumu embriju audu pētījumiem – Anna Miskova (2012), bet par jaundzimušo saauguma slimības skartu audu pētījumiem – Anna Junga (2019). Būtiski pētījumi par kraniofaciālajām anomālijām tiek veikti Latvijas lūpu, aukslēju un sejas šķeltņu centrā profesores Ilzes Akotas vadībā, kur sadarbībā ar RSU aizstāvēti pētījumi par kraniofaciālā skeleta morfoloģiju vecākiem, kuriem ir bērni ar šķeltni (Ieva Mauliņa, Dr. med., 2011), zobu anomāliju veidiem un to saikni ar mutes veselības stāvokli bērniem ar iedzimtām nesindromālām šķeltnēm Latvijā un to saistību ar noteiktiem ģenētiskajiem marķieriem (Kristīne Kadiķe, Dr. med., 2017), par deguna elpošanas funkciju un estētiku bērniem ar caurejošu šķeltni (Ieva Bāgante, Dr. med., 2018).
Arī RSU Dzemdniecības un ginekoloģijas katedrā veikti nozīmīgi pētījumi par augļa intrauterīno augšanas aizturi (Natālija Vedmedovska, Dr. med., 2011), bet RSU Sabiedrības veselības un epidemioloģijas katedrā izstrādāts darbs par iedzimto anomāliju biežumu un ar to saistīto faktoru epidemioloģisko analīzi Latvijā (Irisa Zīle, Dr. med., 2013).
Latvijas Lauksaimniecības universitātē sadarbībā ar RSU veikti nozīmīgi pētījumi embrioloģijas jomā. Tā, liellopu dzeltenuma ķermeņa (corpus luteum) hormonu ekspresiju cikla un grūsnības laikā pētījusi Regīna Tamane (Dr. med. vet., 2004), bet Ilga Šematoviča pētījusi govs dzemdes morfofunkcionālās pārmaiņas dažādos laika periodos pēc atnešanās (Dr. med. vet., 2010).
