Likums “Par bijušās Valsts drošības komitejas dokumentu saglabāšanu, izmantošanu un personu sadarbības fakta ar VDK konstatēšanu” sākotnēji paredzēja, ka VDK dokumenti ir izmantojami tikai, lai politiski, vēsturiski un juridiski izpētītu un izvērtētu materiālo un morālo kaitējumu, ko VDK nodarījusi Latvijas valstij un tās iedzīvotājiem, šo funkciju nododot Totalitāro režīmu dokumentēšanas centram. Ar 2014. gada likuma grozījumiem un Ministru kabineta rīkojumu tika izveidota “Speciālā starpdisciplināra komisija Valsts drošības komitejas dokumentu izpētei atbilstoši likumam “Par bijušās Valsts drošības komitejas dokumentu saglabāšanu, izmantošanu un personu sadarbības fakta ar VDK konstatēšanu”” (saīsināti saukta “LPSR Valsts drošības komitejas zinātniskās izpētes komisija”), kuras mērķis bija VDK dokumentu zinātniska, tostarp vēsturiska un juridiska, izpēte un materiālā un morālā kaitējuma, ko VDK nodarījusi Latvijas Republikai un tās iedzīvotājiem, izvērtēšana. Komisija darbojās no 2015. līdz 2018. gadam un darba noslēgumā publicēja pārskatu, kurā, tostarp ietvēra rekomendācijas attiecībā uz VDK dokumentu publicēšanas apjomu un kārtību. Sekojot šīm rekomendācijām, kopš 2018. gada oktobra publiski internetā ir pieejama daļa LPSR VDK dokumentu arhīva.
1998. gadā pēc Latvijas Valsts prezidenta Gunta Ulmaņa iniciatīvas tika izveidota Latvijas Vēsturnieku komisija, kuras uzdevums ir nacisma un padomju režīma politikas detalizēta izpēte un holokausta izvērtēšana un pētījumu rezultātu izskaidrošana Latvijas iedzīvotājiem. Vēsturnieku komisijā bija izveidotas četras pētnieku grupas abu okupācijas režīmu laikā no 1940. līdz 1956. gadam īstenoto represiju izpētei. Komisija publicējusi 29 zinātnisku rakstu sējumus.