Dzimis Austrijas Impērijas ķeizara, Habsburgu-Lotringu (Habsburg-Lothringen) dinastijas pārstāvja, Franča I (Franz I.), agrākā Franča II (Franz II., pilnajā vārdā Francis Jozefs Karls, Franz Joseph Karl) un viņa sievas Burbonu dinastijas Sicīlijas princeses Marijas Terēzas (Maria Teresa Carolina di Borbone-Napoli) ģimenē. Abi vecāki bija brālēns un māsīca. Vecāku radniecības dēļ no 12 dzimušajiem bērniem izdzīvoja divi dēli un piecas meitas, tostarp vēlākais troņmantnieks Ferdinands. Abu vecāku tuvā radniecība atstāja smagas sekas arī uz Ferdinandu. Viņam bija vairākas iedzimtas slimības (epilepsija, rahīts, hidrocefālija), kuras galms centās noslēpt no publikas. Slimību dēļ Ferdinands vēlu iemācījās staigāt un runāt. Rakstīšanu un lasītprasmi pilnībā apguva 15 gadu vecumā, vēlāk apguva militārās prasmes un dabaszinības. Ferdinanda skološana notika slēgtā vidē Vīnes galmā.
27.02.1831. kroņprincis Ferdinands laulājās ar Sardīnijas Pjemontas princesi Mariju Annu (Maria Anna Ricciarda Carolina Margherita Pia), kura bija viņa attāla radiniece un bija ļoti dievbijīga un pieticīga. Abu precības iniciēja galms; laulībā pēcteču nebija.