Makrofāgi ir mieloīdas šūnas, kas nodrošina nespecifisko imūnaizsardzību. Makrofāgu galvenās īpašības iekļauj sevī fagocitozi un antigēnu prezentāciju: tie spēj ietvert un iznīcināt mikroorganismus, svešķermeņus un mirušās šūnas, kā arī prezentēt antigēnus (vielas, kas izraisa organisma imūnreakciju), veicinot specifisko imūno atbildi pret tiem.
Vēsturiski makrofāgiem tiek izdalīti divi polarizācijas stāvokļi: klasiski aktivētie (M1) un alternatīvi aktivētie makrofāgi (M2 jeb AAM).
M1 ir iekaisumu veicinošais fenotips, kas veidojas mikrobiālās stimulēšanas rezultātā caur Toll līdzīgajiem receptoriem (Toll-like receptors, TLR). TLR atpazīst vīrusiem un baktērijām raksturīgas molekulas, to skaitā lipoproteīnus, lipopolisaharīdus (LPS) un nukleīnskābes. M1 tiek aktivizēti ar interferonu (interferons, IFN) γ, granulocītu-makrofāgu koloniju stimulējošo faktoru (granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, GM-CSF) un LPS. M1 makrofāgi ir saistīti ar I tipa T palīgšūnu (T helper 1, Th1) imūno atbildi, tiem piemīt augsta antigēnu prezentēšanas spēja, un tie izdala iekaisumu veicinošos citokīnus: audzēja nekrozes faktoru α (tumor necrosis factor α, TNFα) un interleikīnus (interleukins, IL) 6, 12 un 23.
M2 ir imūnsupresīvais fenotips, kas tiek inducēts ar IL-4, IL-10, IL-13 un citiem. M2 makrofāgi ir iesaistīti II tipa T palīgšūnu (T helper 2, Th2) imūnās atbildes reakcijās, ekstracelulāru patogēnu aizvākšanā, alerģiskajās reakcijās, bojāto audu atjaunošanā un remodelēšanā. M2 makrofāgiem ir raksturīga IL-10 un transformējošā augšanas faktora (transforming growth factor, TGF) β ekspresija.
Makrofāgu iedalījuma dualitāte atspoguļo ne tikai Th1 un Th2 imūnās atbildes reakcijas, bet arī arginīna metabolismu. M1 makrofāgos inducējamā slāpekļa oksīda sintāze (inducible nitric oxide synthase, iNOS) pārveido arginīnu par NO un citrulīnu. Savukārt M2 makrofāgos argināzes ietekmē no arginīna veidojas ornitīns un urīnviela.
Makrofāgi ir ļoti plastiskas šūnas – tiem piemīt dažādas īpašības atkarībā no tiem apkārt esošās mikrovides. Makrofāgi spēj mainīt savu fenotipu atkarībā no saņemtajiem signāliem. Tādējādi nebūtu pareizi uzskatīt, ka visus makrofāgus var iedalīt vienā no diviem polarizācijas stāvokļiem. Kaut arī zinātnieki ērtības labad turpina izmantot vēsturisko M1/M2 iedalījumu, īstenībā makrofāgiem var izdalīt bezgalīgi daudz starpfenotipu.