Lai arī medicīnas antropoloģija kā oficiāla antropoloģijas joma nostiprinājās 20. gs. vidū, tās iedīgļi meklējami vairākas desmitgades senākā antropoloģijas attīstības vēsturē. Sākotnēji medicīnas antropoloģijas aspekti vienlaikus interesēja kā fiziskos jeb bioloģiskos antropologus, tā arī kultūras un sociālos antropologus – taču interešu virzieni bija daudzējādā ziņā atšķirīgi. Kamēr fiziskie antropologi vienmēr bijuši ieinteresēti veselības un slimības pētniecībā, tai skaitā, mijoties ar arheoloģiju un pētot seno sabiedrību veselības stāvokli, kultūras antropologi sākotnēji izteikti interesējās par maģijas un reliģijas saistību ar medicīnas antropoloģiju. Viljams Riverss (William Halse Rivers) ir viens no agrīnajiem antropologiem, kurš devis nozīmīgu ieguldījumu medicīnas antropoloģijas jomā. V. Riverss veica savu etnogrāfisko pētījumu Austrālijas ziemeļos, un savā darbā uzsvēra, ka medicīnas prakses ir sociāls process, kuru var pētīt ar līdzvērtīgām metodēm kā citus sociālos procesus. V. Riversa darbā arī parādījās nodalījums starp dažādiem slimību dziedināšanas veidiem, nošķirot rituālus un burvestības no biomedicīnas metodēm, kas balstās uz zinātnes principiem un dabas likumiem. Savukārt Ervīns Akerknehts (Erwin Heinz Ackerknecht) uzsvēra to, kā dziedināšanas prakses mēdz atspoguļot plašākas sabiedrības kultūras tradīcijas, kurā tās attīstās. Līdzīgi E. Akerknehta paustajam, 20. gs. vidū medicīnas antropologu vidū vispārīgi izplatījās pieņēmums, ka tas, kas tiek definēts par slimību, nav vienkārši bioloģisks fakts, bet arī sabiedrības lēmums, kas netiek pieņemts individuālā līmenī. Šajā laikā vairāki ietekmīgi antropologi bija samērā daudz iesaistīti praktiskā antropoloģijas prakšu pielietojumā medicīnas jomā, piemēram, konsultējot Pasaules Veselības organizāciju (World Health Organization) par dažādu sabiedrību attieksmi pret organizācijas veiktajām intervencēm. Līdz ar to, sākot ar 20. gs. 50. gadiem, tika arvien plašāk izmantots termins “medicīniskā praksē pielietotā antropoloģija”, ko vēlāk aizstāja termins “medicīnas antropoloģija”. Turpmākajās desmitgadēs antropologi veica arvien plašākus lauka darbus klīniskajā vidē sadarbībā ar medicīnas universitātēm, konsultējot vietējus un starptautiskus publiskās veselības projektus.