Mirušie apbedīti saskaņā ar kristīgo tradīciju – ar galvu uz rietumiem, izņemot trīs, kas guldīti pretēji, un vienu, kas guldīts uz vēdera (visticamāk, kļūme apbedīšanas rituālā). Zem četrām kapa plāksnēm katedrāles iekšienē konstatēti apbedījumi.
Kapsētas pastāvēšanas hronoloģijā izdalāmi divi periodi: 13./14. gs. līdz 16. gs. un 17.–18. gs. sākums. Sākotnēji kapsētā apbedīti vietējie un dažādi nevācu izcelsmes iedzīvotāji un tie, kas nebija pilsētnieki. 17. gs. tā lielā mērā kļuva par zviedru garnizona kapsētu. Kopumā arheoloģiski pētīti un antropoloģiski noteikti 348 kapi.
Antropoloģiskā materiāla analīze, ko veikusi Gunita Zariņa, rāda vidēji lielu kapsētā apbedīto augumu (vīriešiem 171,2 cm, sievietēm 158,2 cm, atsevišķos gadījumos vīriešiem sasniedzot pat 180–185 cm), labu zobu stāvokli līdz pat 50 gadu vecumam (tādējādi parādās atšķirība ar ārpus katedrāles apbedītajiem, kas liecina, ka katedrāles iekšienē apbedīti turīgāki un augstāka sociāla statusa rīdzinieki), augstu bērnu (75 % no tiem ir vecumā līdz diviem gadiem) un jaunu sieviešu mirstību. Ievērojamā mazu bērnu un jaunu sieviešu mirstība norāda arī uz sociāli aizsargāto slāņu bezspēcību slimību gadījumos.
Atsevišķos apbedījumos katedrāles iekšpusē iegūti izcili tekstiliju paraugi, piemēram, zīda adījumi, brokāta lentes ar zelta un sudraba pavedieniem. Vairākos kapos konstatētas ievietotas lauru lapas (piemēram, 318. kapā). Šo tradīciju, iespējams, var saistīt ar kristīgo mūžīgās dzīvības simboliku.
2021.–2023. gadā katedrāles iekšienē atsegtas 10 kapa plāksnes un lielāki to fragmenti, kā arī izpētīti 50 veseli un daļēji saglabājušies apbedījumi. 2024. gadā tika atkārtoti atsegtas un dokumentētas arī priekšnamā zem mūsdienu grīdas esošās kapa plāksnes.
2022.–2023. gadā katedrāles ziemeļu joma 3. travejā tika izbūvēta speciāla novietne izrakumos iegūtā antropoloģiskā materiāla uzglabāšanai – osārijs (osuārijs). Tas tika izbūvēts vietā, kur vēsturiski notikusi mirušo izvadīšana un 18. gs. J. K. Broces zīmētajā plānā parādās kā “kādreizējais kaulu kambaris”.
Jaunatklātās kapa plāksnes pēc remonta izceltas un integrētas tagadējās grīdas līmenī ziemeļu un centrālajā jomā, tām piešķirts mākslas pieminekļa statuss. Izcilākā no tām novietota dienvidu jomā pie sienas.
Ap katedrāli atradušies arī ievērojama apjoma kaulu krāvumi, t. s. kaulu kambari, kas veidojušies vairāku gadsimtu laikā, beidzoties brīvai vietai jauniem apbedījumiem.