Biotopu atjaunošana ietver praktiskas darbības, kas vērstas uz degradētu (viena vai vairāku ekoloģisko faktoru aspektos) biotopu atjaunošanu. Biotopu atjaunošanā ir sagaidāmi izmērāmi rezultāti, tādēļ šajā procesā izmanto atsauces (references) vērtības – kvantitatīvus parametrus, kurus sasniedzot sagaidāma zudušo vai traucēto biotopu funkciju atjaunošanās laika gaitā.
Pastāv vairākas pieejas biotopu atjaunošanai, piemēram, pasīvā atjaunošana (dabiskā atjaunošanās), aktīvā atjaunošana (apmežošana, dambju izbūve vai izjaukšana, sugu reintrodukcija) un dabiskošana (rewilding), kā arī ekoloģiskā inženierija.