Līdz Latvijas okupācijai Liepāja izvirzījās kā otrs nozīmīgākais valsts futbola centrs, konkurējot ar Rīgu. Šajā laikā Liepājas klubs “Olimpija” septiņas reizes kļuva par Latvijas čempionvienību. Pēc padomju okupācijas Liepājas komandas ar labiem panākumiem spēlēja republikas čempionātā – no 1945. līdz 1959. gadam Liepājas pārstāvji (sākumā “Daugava”, tad “Sarkanais metalurgs”) deviņas reizes uzvarēja Latvijas PSR čempionātā, bet jāņem vērā, ka tajā laikā jau Rīgas meistarkomanda piedalījās PSRS čempionātā. 1955. gadā Liepājas komanda gan nosacīti debitēja PSRS meistarsacīkstēs, jo iepriekšējās sezonas beigās Latvijas PSR Ministru Padomes Fiziskās kultūras un sporta komiteja nolēma, ka Rīgas “Daugavas” meistarkomandai ir jāapliecina savas tiesības piedalīties PSRS čempionātā divās spēlēs ar republikas čempioniem Liepājas “Sarkano metalurgu”. Šie mači noslēdzās ar negaidītu liepājnieku uzvaru (divu spēļu summā – 3:2). Drīz pēc tam 1955. gadā uz vienu sezonu tika izveidota kopējā komanda “Sarkanais metalurgs”/“Daugava”, apvienojot abu komandu futbolistus, kas bāzējās Rīgā, tikai dažus mačus aizvadot Liepājā.
Pilnvērtīgi PSRS meistarsacīkstēs Liepājas komanda debitēja 1960. gadā, kad pēc PSRS meistarsacīkšu reorganizācijas Rīgas “Daugava” tika iecelta augstākajā līgā jeb A klasē, bet divas labākās republikas čempionāta komandas – Rīgas RER un “Sarkanais metalurgs” – ieguva iespēju spēlēt PSRS meistarsacīkšu B klasē. Nosaukumu “Zvejnieks” Liepājas futbola komanda ieguva 1962. gadā, kad šo vienību savā pārziņā pārņēma zvejnieku kolhozs “Boļševiks”. Ar šādu nosaukumu komanda spēlēja 28 sezonas. Kopš 1963. gada, RER atgriežoties republikas čempionātā, “Zvejnieks” palika par otro Latvijas PSR pārstāvi PSRS meistarsacīkstēs aiz Rīgas “Daugavas”. 1963. gadā “Zvejnieks” guva savu labāko panākumu PSRS meistarsacīkstēs, B klasē 16 komandu konkurencē ieņemot 7. vietu (sākot ar šo gadu, pēc kārtējās PSRS meistarsacīkšu reorganizācijas B klase bija pēc skaita trešā līga, ko 1971. gadā pārdēvēja par PSRS čempionāta otro līgu).
Pēc Rīgas “Daugavas” izkrišanas no PSRS čempionāta pirmās līgas uz otro abas Latvijas PSR vienības ilgāku laiku spēlēja vienā līmenī (1972–1975 un 1977–1981). “Zvejniekam” ne reizi neizdevās turnīra tabulā apsteigt Rīgas komandu, taču atsevišķos gadījumos liepājnieki sagādāja “Daugavai” sāpīgus zaudējumus. Piemēram, 1973. gadā “Zvejnieks” ar “Daugavu” Liepājā spēlēja neizšķirti 0:0, bet liepājnieki bija pārāki 11 m sitienu sērijā (šajā sezonā PSRS futbola funkcionāri bija pieņēmuši neparastu lēmumu, ka neizšķirtu gadījumā jārīko pēcspēles sitienu sērija, kur zaudētāji nesaņēma nevienu punktu), un čempionāta finišā “Daugavai” pietrūka tikai divu punktu, lai ieņemtu pirmo vietu un iespēju atgriezties pirmajā līgā. “Zvejnieks” savā laukumā apspēlēja “Daugavu” arī 1974. (1:0) un 1979. gadā (2:0). Tomēr kopumā abu Latvijas PSR komandu savstarpējos mačos PSRS čempionātā “Zvejnieks” daudz biežāk piekāpās “Daugavai” – savstarpējos mačos tam bijušas divas uzvaras, seši neizšķirti un 14 zaudējumi. Izņemot “Daugavu”, par “Zvejnieka” principiālākajiem pretiniekiem tradicionāli tika uzskatīti Klaipēdas “Atlantas”. Tāpat Liepājas komanda PSRS čempionātos divas reizes uzvarēja arī Lietuvas PSR galveno komandu Viļņas “Žalgiris” (1972. un 1976. gadā – abās spēlēs 1:0), kas vēlāk veiksmīgi spēlēja PSRS čempionāta augstākajā līgā.
1988. gadā PSRS čempionāta otrajā līgā atkal parādījās vēl viena Latvijas komanda – jaunizveidotā Jelgavas RASMS-RAF. Tieši šajā sezonā “Zvejnieks” atkārtoja savu labāko sasniegumu, 18 komandu konkurencē finišējot septītajā vietā. Brūkot PSRS sistēmai, no komandas uzturēšanas atteicās kolhozs “Boļševiks”, un pirms 1990. gada sezonas Liepājas komanda mainīja nosaukumu, atgriežoties pie “Olimpija” un atkal ieņemot septīto vietu. Šī komandai izrādījās pēdējā sezona PSRS meistarsacīkstēs, jo 1991. gadā liepājnieki atteicās no šādas iespējas, lai gan Rīgas un Jelgavas komandas PSRS meistarsacīkstēs piedalījās vēl vienu sezonu.
Līdz 1968. gadam “Zvejnieks” arī piedalījās PSRS kausa izcīņā, kur nekādus panākumus neguva, kopumā šajā turnīrā aizvadot tikai 11 spēles un vienmēr izstājoties jau pirmajās kārtās.