Ūdeņu strupastes ar ūdens dzīvesveidu galvenokārt dzīvo saldūdens tilpju piekrastēs un dod priekšroku nelielām, aizaugušām, stāvošām vai lēni tekošām upēm, ezeriem, retāk purviem. Strupastes slēpjas blīvā piekrastes veģetācijā. Sauszemes strupastes apmetas ganībās, pļavās, meža izcirtumos un dārzos. Tās rok plašas alu sistēmas ar sazarotiem tuneļiem, midzeņu kamerām un barības krātuvēm. Pieaugušajiem indivīdiem ir sava individuālā teritorija. Lai to uzturētu, tie ar pakaļkājām aktīvi skrāpē savus spilgti oranžos sānu ādas dziedzerus, pēc tam nomīda vecos izkārnījumus un apkaisa tos ar svaigiem. Iezīmēšana ar smaržu biežāk notiek vairošanās periodā. Tēviņu teritorija parasti ir lielāka nekā mātīšu. Abu dzimumu strupastes iezīmē teritoriju. Tēviņu teritorijas pārklājas ar abu dzimumu teritorijām, bet mātītes aizstāv savu teritoriju no citām mātītēm. Gan tēviņi, gan mātītes vairošanās sezonā izrāda agresiju pret sava dzimuma īpatņiem. Sugai ir raksturīga promiskuitāte, puse metienu ir 2–3 tēviņu pēcnācēji. Dienvidu reģionos vairošanās notiek gandrīz visu gadu, taču mērenajā klimatā tā ir no aprīļa līdz septembrim. Mātīte sezonā spēj laist pasaulē 1–5 metienus, katrā ir 4–6 mazuļi. Grūsnība ilgst 21–22 dienas, mātīte baro mazuļus ar pienu 22 dienas. Vienu mēnesi veci indivīdi pamet mātītes midzeni. Parasti dzimumbriedumu tie sasniedz divu mēnešu vecumā un sāk meklēt savu teritoriju. Ūdeņu strupaste labi peld un nirst, var nodzīvot līdz pat trijiem gadiem, bet tikai daži īpatņi pārdzīvo otro ziemu. Visilgākais reģistrētais izdzīvošanas laiks nebrīvē bija 955 dienas.
Veģetācijas periodā pamatbarība ir augu zaļās virszemes daļas un sulīgas pazemes daļas: sakneņi, gumi, bumbuļi u. c. Ūdeņu strupastes ēd arī kukaiņus un gliemjus, dažreiz medī vardes un kurkuļus; acīmredzot tie kompensē olbaltumvielu trūkumu uzturā. Ziemā pārtiek no atrodamās augu barības pazemē, kā arī uzkrāj barību, reizēm vairākus kilogramus.