Latvijas PSR VDK aģentūras kartotēkas bija viens no VDK aģentūras aparāta uzskaites līdzekļiem. Šīs kartotēkas tika izmantotas gan aģentūras uzskaitei, gan arī ar aģentūru saistītās dokumentācijas operatīvai meklēšanai. Aģentūras aparātā bija aģenti, rezidenti, konspiratīvo dzīvokļu un satikšanās dzīvokļu turētāji. Aģentūras kartotēkās atrodami arī kandidāti vervēšanai un vervēšanas rezerve “īpašajam periodam” (t. i., kara gadījumā), taču šīs kategorijas netika uzskatītas par aģentūras aparāta sastāvdaļu.
VDK aģentūras kartotēku veidošanu, kartītēs iekļaujamo informāciju un tās apjomu reglamentēja Padomju Sociālistisko Republiku Savienības (PSRS) VDK izdotas pavēles un instrukcijas. Katrā PSRS republikā bija sava VDK aģentūras uzskaite. Bez tam savu aģentūru uzskaitīja arī PSRS karaspēka daļu sevišķās daļas, kā arī citas VDK struktūrvienības.
VDK aģentūras uzskaites pamats bija alfabētiskā kartotēka un statistiskā kartotēka. LPSR VDK aģentūras uzskaites alfabētiskā kartotēka saturēja ziņas ne tikai par aktīvo aģentūru, bet arī par kandidātiem vervēšanai, vervēšanas rezervi “īpašajam periodam” un nesen no aktīvās aģentūras izslēgtajiem cilvēkiem (t. s. arhīva aģenti). Alfabētiskajā kartotēkā kartītes bija sakārtotas pēc aģentu uzvārdiem, krievu alfabēta secībā. Pēc aģenta izslēgšanas no aktīvās aģentūras, šā aģenta kartīte alfabētiskajā kartotēkā tika turēta vairākus gadus, bet vēlāk izņemta un iznīcināta. Tiem aģentiem, kurus VDK darbinieki uzskatīja par sevišķi vērtīgiem, kartītes alfabētiskajā kartotēkā varēja glabāties pastāvīgi, arī pēc pašu aģentu nāves. Savukārt LPSR VDK aģentūras uzskaites statistiskajā kartotēkā bija kartītes tikai par aktīvo aģentūru un šajā kartotēkā kartītes bija sakārtotas pēc VDK struktūrvienībām un aģentu pseidonīmiem. Pēc aģenta izslēgšanas no aktīvās aģentūras, šā aģenta kartīte no statistiskās kartotēkas tika izņemta un iznīcināta. Nepieciešamības gadījumā VDK struktūrvienībām bija tiesības aģentūras uzskaitei veidot arī papildkartotēkas. Latvijā ir saglabājusies LPSR VDK aģentūras uzskaites papildus kartotēka, kurā minēti aģentu un rezidentu vārdi, kurus, “īpašā perioda” gadījumā, bija jānosūta PSRS bruņoto spēku struktūrvienībām.
Vairums no Latvijā esošajām LPSR VDK aģentūras kartītēm ir tapušas PSRS pastāvēšanas pēdējās desmitgadēs (70.–80. gados), taču alfabētiskajā kartotēkā ir arī daži simti kartīšu ar cilvēku vārdiem, kurus LPSR valsts drošības iestādes savervēja 20. gs. 40. gados. Parasti kartītes tika sastādītas tuvāko dienu laikā pēc cilvēka savervēšanas, taču attiecībā uz 40. gados savervētajiem aģentiem nereti iespējams konstatēt, ka kartīte par viņu savervēšanu sastādīta 50.–70. gados.
Bez Latvijas PSR VDK, sava aģentūra Latvijā bija arī citām PSRS VDK struktūrām (Baltijas kara apgabala Sevišķajai daļai un Baltijas robežapsardzības apgabalam), taču to aģentūras dokumenti Latvijā neatrodas un plašākai izpētei nav pieejami.
