Dzimis 13.01.1910. Baldones pagastā kalēja Teodora Arāja un viņa sievas vācbaltietes Bertas Annas (dzimušas Burkevicas) ģimenē. Viktoru un jaunāko māsu Elvīru uzaudzināja māte, jo viņu tēvu Pirmā pasaules kara laikā mobilizēja Krievijas Impērijas armijā un ģimenē viņš vairs neatgriezās. No 1922. gada V. Arājs dzīvoja Jelgavā, kur pabeidza pilsētas 4. pamatskolu, bet 1930. gadā absolvēja Valsts Jelgavas klasisko ģimnāziju. Īslaicīgi darbojās organizācijā “Viestura savienība” un latviešu tautas apvienībā “Pērkonkrusts”. 1931.–1932. gadā bija obligātajā karadienestā Latvijas armijas Vidzemes artilērijas pulkā, iegūstot kaprāļa dienesta pakāpi.
Vēl atrazdamies karadienestā, V. Arājs 1932. gadā uzsāka mācības Latvijas Universitātes Tautsaimniecības un tiesību zinātņu fakultātes Tiesību zinātņu nodaļā, kur studēja ar pārtraukumiem. 1935. gadā V. Arājs kļuva par studentu korporācijas “Lettonia” biedru. Strādāja gadījuma darbus un bija kārtībnieks policijas dienestā Rīgā un Zaubē. 1938. gadā V. Arājs apprecējās ar vairāku Zaubes veikalu īpašnieci Zelmu Zeiboti. Nokārtot gala pārbaudījumus universitātē un iegūt jurista diplomu V. Arājam izdevās tikai 10.03.1941. un atkārtoti – 15.04.1944., jo vācu okupācijas laikā netika atzīti padomju okupācijas varas izdoti izglītības dokumenti.