Samārijam ir septiņi dabā sastopami izotopi: samārijs-144 (3,1 %), samārijs-147 (15,0 %), samārijs-148 (11,2 %), samārijs-149 (13,8 %), samārijs-150 (7,4 %), samārijs-152 (26,8 %) un samārijs-154 (22,8 %). No tiem trīs izotopi ir radioaktīvi – samārijs-147, samārijs-148 un samārijs-149. Taču šo izotopu pussabrukšanas periodi ir tik gari, ka tos pieskaita pie stabiliem izotopiem. No tiem samārijs-147 ir ar īsāko pussabrukšanas periodu 1,1×1011 gadi. Līdztekus dabīgajiem izotopiem samārijam ir zināmi arī vairāki radioizotopi, piemēram, samārijs-151, kura pussabrukšanas periods ir 94,6 gadi, un samārijs-145, kura pussabrukšanas periods ir 340 dienas. Visiem pārējiem radioaktīvajiem samārija izotopiem (no samārija-129 līdz samārijam-168) pussabrukšanas periodi ir īsāki par dažām dienām, lielākajai daļai tie ir īsāki par vienu minūti. Viens no samārija radioaktīvajiem izotopiem, samārijs-153, tiek izmantots medicīnā. Pacienti ar ļaundabīgo kaulu audzēju bieži cieš no ļoti stiprām sāpēm. Samārijs-153 palīdz tās mazināt, ja to ievada pacientam injekcijas veidā kā medikamentu.