Gludsporu ezerene ir daudzgadīgs, mūžzaļš ūdensaugs, kas sakņojas gruntī. Lielu daļu no auga biomasas sastāda spēcīgā sakņu sistēma. Lapas tumši zaļas, īlenveida, sakārtotas blīvā rozetē, pie pamata platākas. Lapu garums 5–15 cm, diametrs 1,5–3 mm. Dziļāk augošiem augiem lapas ir garākas un taisnākas, seklākā ūdenī augošiem – īsākas un izteikti izliektas. Katrā lapā atrodas četri gareniski gaisa dobumi, kas ir atdalīti ar plānām membrānas sienām. Lapas paplašinātajā daļā veidojas sporas. Rozetes ārējās lapās veidojas sievišķās sporas (megasporas), iekšējās lapās attīstās vīrišķās sporas (mikrosporas). Rozetes vidējām lapām sporangiju nav, ar tām augi pārziemo. Ārējās lapas veģetācijas perioda beigās atmirst, sporangiji satrūd, atbrīvojot sporas, kuras izplata ūdens. Sporas nogatavojas no jūlija līdz septembrim.