Pildot iekšlietu ministra pienākumus, S. Vojcehovskis nodrošināja mierīgu vēlēšanu norisi Likumdevēju Seima (Sejm Ustawodawczy) vēlēšanās 1919. gada 26. janvārī; viņš organizēja sabiedriskos darbus, centrālās varas un pašpārvaldes, kā arī valsts policijas funkcionēšanu. Būdams prezidents, viņš saskārās ar valsts politizāciju, nestabilām un bieži mainīgām valdībām, kā arī sociālo nemieru vilni, ko izraisīja augošā inflācija. 1923. gada decembrī S. Vojcehovskis iecēla V. J. Grabska vadīto ārpusparlamentāro ekspertu valdību un atbalstīja to ekonomisko reformu īstenošanā, budžeta līdzsvarošanā, neatkarīgas centrālās bankas izveidē un jaunas valūtas – poļu zlota – ieviešanā. 1926. gada sākumā starp valdību un J. Pilsudski izcēlās konflikts par kara lietu ministra iecelšanu un likumprojekta par armijas vadību formulējumu; Vincentija Vitosa (Wincenty Witos) valdības iecelšanu 1926. gada 10. maijā J. Pilsudskis uztvēra kā parlamentārā vairākuma provokāciju, – viņš šo vairākumu uzskatīja par atbildīgu G. Narutoviča slepkavībā. S. Vojcehovskis neticēja, ka J. Pilsudskis varētu sarīkot bruņotu apvērsumu pret likumīgi ieceltu valdību. Viņš kļūdījās. Dramatiskā brīdī 1926. gada 12. maijā, kad J. Pilsudskis veda sev uzticīgās karaspēka vienības uz Varšavu, S. Vojcehovskis tikās ar viņu uz Poņatovska tilta (tilts, kas nosaukts prinča Juzefa Poņatovska, Józef Poniatowski, vārdā). Sarunas laikā viņš aizstāvēja likumīgo varu. Tomēr, kad Varšavā sākās kaujas un J. Pilsudska spēki guva virsroku, nevēlēdamies izraisīt pilsoņu karu, S. Vojcehovskis 1926. gada 14. maijā iesniedza atlūgumu Seima maršalam Macejam Ratajam (Maciej Rataj). Otrā pasaules kara laikā viņš dzīvoja savās mājās Varšavā. Viņu dziļi satrieca dēla Edmunda – jurista – nāve; vācieši viņu bija arestējuši un noslepkavojuši Aušvicas nāves nometnē.