Hidrokonozojiem bija raksturīga starainā simetrija. Tiem bija viena simetrijas ass, ap kuru staraini izvietojās orgāni. Hidrokonozoji ir zināmi pēc to skeleta fosilijām, un to mīksto ķermeņa daļu uzbūve un dzīvesveids nav pilnībā zināmi. Hidrokonozoju ārējais skelets bija veidots galvenokārt no slāņainām, iegarenām vai rombveida kalcija karbonāta plātnītēm, kas veidoja organisma ārējo balstu. Skelets bija iegarens, kausa vai cilindriskas formas un līdz 30 mm augsts. Skeletā bija centrālais dobums vai kanālu sistēma, kas atsevišķām grupām varēja būt saistīta ar ķermeņa iekšējo uzbūvi. Dažu grupu fosilijās ir atrastas staraini simetriski izvietotas plātnītes, kas ir koraļļu skeleta septām vai tabulām līdzīgas struktūras. Konusa centrālajā daļā varēja atrasties hidrokonozoju īpatņa galvenās ķermeņa daļas. Hydroconus ģints pārstāvjiem skeletā ir atklāti īpaši biokristāli, kas veido skeleta mikrostruktūru. Šīs ģints hidrokonozoju koniskā skeleta iekšpusē atradās centrālais kanāls, ko zinātnieki salīdzina ar zarndobumaiņu gastrovaskulāro sistēmu un dobumu. Ap centrālo kanālu šiem hidrokonozojiem bija staraini izvietotas kalcija karbonāta plātnītes. Gastroconus iekšējo uzbūvi veidoja savdabīgas iekšējās struktūras. Hidrokonozoju ķermeņa pamatne nodrošināja dzīvnieku piestiprināšanos pie jūras gultnes vai cita veida cietā substrāta. Uzskata, ka hidrokonozojiem bija mazkustīgs dzīvesveids un ka tie aktīvi nepārvietojās. Hidrokonozoju fosilijās nav atrastas droši apstiprinātas nervu struktūras vai specializēti maņu orgāni, bet uzskata, ka tiem nervu sistēma varēja būt vienkārša, izkliedēta nervu tīkla veidā. Fosilijās nav konstatēti specializēti elpošanas orgāni un izvadorgāni. Iespējams, gāzu apmaiņa un vielmaiņas galaproduktu izvadīšana notika difūzijas veidā caur visu ķermeņa virsmu vai mutes atveri. Līdz šim fosilijās nav atrasti pierādījumi par hidrokonozoju vairošanās veidu.