GalvenÄs pÄtniecÄ«bas metodes fikoloÄ£ijÄ: bioÄ·Ä«miskÄs metodes, Ä·Ä«miski analÄ«tiskÄs metodes, hidrobioloÄ£iskÄs metodes un limnoloÄ£iskÄs metodes, piemÄram, fitoplanktona ievÄkÅ”ana ar ApÅ”teina tÄ«kliÅu. PÄtÄ«jumos par aļģu mijiedarbÄ«bu ar vides faktoriem izmanto fizikÄli Ä·Ä«miskÄs metodes, piemÄram, Å«dens caurspÄ«dÄ«guma noteikÅ”ana ar Seki disku, elektrovadÄ«tspÄjas, skÄbuma (pH), redokspotenciÄla, vides sÄļuma un skÄbekļa daudzuma noteikÅ”ana ar multifunkcionÄlÄs zondes palÄ«dzÄ«bu. Aļģes lÄ«dz sugai nosaka ar caurejoÅ”Äs gaismas mikroskopu, bet fitoplanktona biomasu un skaitīŔanu veic ar invertÄ mikroskopa palÄ«dzÄ«bu. Taksonomisko sugu sastÄvu nosaka ar aļģu noteicÄju palÄ«dzÄ«bu.
ÅŖdens kvalitÄtes noteikÅ”anÄ izmanto bioloÄ£iskÄs analÄ«zes metodi, kurÄ tiek izmantotas aļģu sugas ā indikatororganismi, kas raksturÄ«gi dažÄdÄm Å«dens organiskÄ piesÄrÅojuma pakÄpÄm. PÄc tÄ, kÄdas un kÄdÄ daudzumÄ indikatororganismu sugas sastopamas Å«denÄ«, var spriest par Å«dens un Å«denstilpnes tÄ«rÄ«bu. Ir sugas, kas labi attÄ«stÄs tikai tad, ja piesÄrÅotÄ«ba ir augsta, bet, organisko vielu daudzumam Å«denÄ« samazinoties, iet bojÄ; tad to vietÄ sÄk attÄ«stÄ«ties citas sugas, kam nepiecieÅ”ama zemÄka piesÄrÅotÄ«ba; visbeidzot, Å«denim pilnÄ«gi attÄ«roties, parÄdÄs sugas, kas spÄj dzÄ«vot tÄ«rÄ Å«denÄ«. Zinot, kÄdÄ organiskÄ piesÄrÅojumÄ attÄ«stÄs noteiktas aļģu sugas, iespÄjams pÄc aļģu sugas sastopamÄ«bas noteikt Å«dens piesÄrÅotÄ«bu.