Vilgāles ezers ir glaciālas izcelsmes ezers, kas izveidojies pēdējā apledojuma ledāja darbības rezultātā Rietumkursas augstienes Kurmāles pauguraines dienvidu daļā 62,6 m virs jūras līmeņa netālu no Vārdupes kalna (138 m virs jūras līmeņa) – vienā no Latvijā lielākā saldūdens kaļķiežu iegulu koncentrācijas areālā. Ezers izveidojies ovālā ziemeļrietumu–dienvidaustrumu virzienā orientētā ezerdobē ar smailu ziemeļrietumu galu, kurš ir aizaudzis un pārpurvojies. Ezera platība ir 2,425 km2 (242,5 ha), kopā ar salu 2,43 km2. Tā lielākais garums ir 2,5 km, platums – 1,2 km. Ezerā ir viena neliela sala – 0,5 ha, 64,2 m virs jūras līmeņa. Ezera ziemeļdaļa ir seklāka salīdzinājumā ar tā dienviddaļu. Tajā dziļums vidēji mainās no 1 līdz 2,5 m. Savukārt, ezera dienviddaļā dziļums ir lielāks un sasniedz 3 m, kā arī tur ir konstatēta ezera dziļākā vieta – 3,6 m. Aprēķināts, ka ezera vidējais dziļums ir 1,9 metri.
Neskatoties uz dziļuma atšķirībām, ezera gultne kopumā ir līdzena ar dūņu un sapropeļa slāni virs smilts nogulumiem, bet virsējo slāni ezera gultnes lielākajā daļā veido vidēji 1–2 m biezs ezerkaļķu slānis. Ezera krasti ezerdobes ietvaros kopumā ir lēzeni, bet tālāk to ieskauj paugurains reljefs, it īpaši austrumos no ezera.
Ezers ir eitrofs, vidēji aizaudzis un to kopš 20. gs. vidus ir ietekmējusi cilvēku darbība.
Pēc administratīvā iedalījuma ezers atrodas Kuldīgas novada Kurmāles pagastā, 14 km uz dienvidrietumiem no Kuldīgas.