ES dabas aizsardzības prioritāte ir bioloģiskās daudzveidības un tās sniegto ekosistēmu pakalpojumu saglabāšana un atjaunošana. Politikas īstenošanas pamatā ir bioloģiskās daudzveidības aizsardzība aizsargājamās dabas teritorijās un ārpus tām. Vienlaikus Latvijai ir tiesības noteikt arī citas prioritātes dabas daudzveidības saglabāšanai. Piemēram, aizsargājamo dabas pieminekļu sarakstā blakus bioloģiski daudzveidīgi nozīmīgām teritorijām ir arī teritorijas un objekti ar augstu ģeoloģisko un ģeomorfoloģisko vērtību, kultūrvēsturiski un ainaviski nozīmīgas teritorijas. Svarīga nozīme ir sabiedrības viedoklim, ko pauž nevalstiskās organizācijas un citas interešu grupas. Latvija pievienojusies nozīmīgākajām dabas un vides aizsardzības konvencijām, t. sk. sešām Apvienoto Nāciju Organizācijas (United Nations) dabas aizsardzības konvencijām, no kurām izriet praktiskas dabas aizsardzības rīcības. Pildot Konvencijas “Par starptautiskās nozīmes mitrājiem, īpaši kā ūdensputnu dzīves vidi” (The Ramsar Convention on Wetlands of International Importance especially as Waterfowl Habitat) jeb Ramsāres konvencijas prasības mitrāju aizsardzībai, Latvijā ar likumu noteiktas sešas Ramsāres vietas: Teiču un Pelečāres purvu komplekss (24 000 ha), Engures ezers (18 000 ha), Kaņiera ezers (1200 ha), Lubānas mitrāju komplekss (47 902 ha), Ziemeļu purvi (5318 ha) un Papes mitrāju komplekss (51 725 ha). Atbilstoši CITES konvencijai “Par starptautisko tirdzniecību ar apdraudētajām savvaļas dzīvnieku un augu sugām” (The Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora) vairāk nekā 5000 apdraudēto dzīvnieku un 15 000 augu sugu indivīdiem vajadzīga atļauja, lai tos ievestu Latvijā un citās valstīs. Rīgas lidostā regulāri kontrolē un aiztur pasažierus, kas iegādājušies izstrādājumus, kas izgatavoti no apdraudētām savvaļas dzīvnieku vai augu sugām un kuriem nav CITES atļaujas. Konvencijas “Par migrējošo savvaļas dzīvnieku aizsardzību” (The Convention on the Conservation of Migratory Species of Wild Animals) īstenošanas nolūkos Latvijā tiek piešķita kompensācija zemniekiem par īpaši aizsargājamo nemedījamo sugu un migrējošo sugu dzīvnieku nodarītajiem postījumiem.
