Dzimis Delunboldakā, Ononas upes krastā. Bordžiginu (Borjigin) klana galvas un taičiutu cilts vadoņa Jesigaja (Yesügai) ģimenē. Deviņu gadu vecumā zaudēja tēvu, nonāca dziļā nabadzībā. Pusaudža gados vairākkārt nonāca naidīgu klanu vai cilšu gūstā, pat verdzībā. Pēc pilngadības sasniegšanas kļuva par keraītu cilts hana Toorila (Toghril; arī Van hans, On hans; Van khan; ķīniešu 王汗, Wáng Hàn; Ong Khan) vasali. Ar ģimeni apmetās sava bērnības asinsbrāļa, Džadžiratu klana vadoņa Džamuhas (Жамуха сэцэн) ordā.
Bez milzuma konkubīņu, Čingishanam bija četras likumīgās sievas: Borte (Бөртэ үжин), Hulana (Хулан хатан) un Jesugena (Есүгэн хатан) un Jesuja (Есүй хатан). Borte tam dzemdēja četrus dēlus: Džuči (Зүчи хан), Čagataju (Цагадай хан), Udegeju (Өгэдэй хаан) un Toluju (Тулуй еке ноён), kā arī piecas meitas. Tikai Bortes dēlu pēcteči varēja pretentēt uz ievēlēšanu par haniem.