Daugavpils uzņēmumi, kam ir lielākais apgrozījums: SIA “Daugavpils reģionālā slimnīca” (slimnīcu darbība, reģistrēta 2002. gadā), SIA ”Intergaz Trade” (degvielas, cietā, šķidrā un gāzveida kurināmā un līdzīgu produktu vairumtirdzniecība, reģistrēta 2018. gadā), SIA “Euro Energo Company” (degvielas, cietā, šķidrā un gāzveida kurināmā un līdzīgu produktu vairumtirdzniecība, reģistrēta 1992. gadā), a/s ”Daugavpils lokomotīvju remonta rūpnīca” (dzelzceļa lokomotīvju un ritošā sastāva ražošana, reģistrēta 1991. gadā), a/s “Latvijas maiznieks” (maizes ražošana, reģistrēta 1991. gadā), SIA ”Axon Cable” (elektronisko un elektrisko vadu un kabeļu ražošana, reģistrēta 2000. gadā).
2022. gadā Daugavpilī bija apmēram 4 100 ekonomiski aktīvo uzņēmumu. Nozaru griezumā lielākais uzņēmumu skaits bijis tirdzniecības un auto un moto remonta nozarē – 35 %, apstrādes rūpniecības, transporta un uzglabāšanas nozarē – 9 %, profesionālo, zinātnisko un tehnisko pakalpojumu sniegšanā – 8 %, būvniecības nozarē – 7 %.
Daugavpils pilsēta vēsturiski ir attīstījusies kā industriāls centrs, kas arī mūsdienās nosaka rūpniecības nozaru attīstību. Rūpniecības struktūru pēc uzņēmumu skaita 2022. gadā veidoja metālapstrāde un mašīnbūve (36 %), koksnes, koka un korķa izstrādājumu ražošana (12 %), tekstilizstrādājumu un apģērbu ražošana (11 %), pārtikas produktu un dzērienu ražošana (10 %), mēbeļu ražošana (8 %) un citas nozares, savukārt pēc apgrozījuma – metālapstrāde un mašīnbūve (39 %), pārtikas produktu un dzērienu ražošana (21 %), datoru, elektronisko un optisko iekārtu ražošana (11 %), ķīmisko vielu un produktu ražošana (9 %) un citas nozares.
Desmit pilsētas uzņēmumi, kam 2022. gadā bija lielākais neto apgrozījums: SIA “Euro Energo Company”, SIA “Daugavpils reģionālā slimnīca”, a/s “Daugavpils lokomotīvju remonta rūpnīca”, a/s ”Latvijas maiznieks”, SIA “Axon Cable”, SIA ”Zieglera Mašīnbūve” (lauksaimniecības un mežsaimniecības mašīnu ražošana, reģistrēta 1997. gadā), SIA “Nexis Fiber” (sintētisko šķiedru ražošana, reģistrēta 2007. gadā), SIA ”East Metal” (metāla konstrukciju un to sastāvdaļu ražošana, reģistrēta 1997. gadā), SIA “Pulsar Optics” (optisko instrumentu un fotoaparatūras ražošana, reģistrēta 2020. gadā), VSIA “Daugavpils psihoneiroloģiskā slimnīca” (slimnīcu darbība, reģistrēta 1998. gadā).
Lielākie darba dēvēji ir SIA “Daugavpils reģionālā slimnīca”, VSIA ”Daugavpils psihoneiroloģiskā slimnīca”, SIA “Axon Cable”, a/s ”Daugavpils satiksme”, SIA “Daugavpils dzīvokļu un komunālās saimniecības uzņēmums”.